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保存完好的死后肺癌标本可用于基因和分子分析

导读 佛罗里达州坦帕市-具有针对性疗法的精密医学已导致改善的治疗选择和患者预后。这些方法是通过研究实验室中生长的肿瘤以及在治疗之前和治疗...

佛罗里达州坦帕市-具有针对性疗法的精密医学已导致改善的治疗选择和患者预后。这些方法是通过研究实验室中生长的肿瘤以及在治疗之前和治疗期间获得的患者样品开发的。但是,通常缺乏足够的患者样本来进行充分研究,并且存在的样本并不能总是完整地说明患者对特定药物的反应以及治疗失败的原因的完整遗传故事。研究人员需要一种更好的方法来确定肿瘤对治疗的反应方式以及如何抵抗药物治疗。

在《癌症医学》上发表的一篇文章中,莫菲特癌症中心的科学家们描述了一个基于社区的计划,称为快速组织捐赠(RTD)协议。它使患者能够在死亡后同意捐赠肿瘤组织和血液样本用于研究。患者死后提供的样本使研究人员能够研究患者治疗失败后原发性和转移性肿瘤的遗传和分子组成,并将发现的结果与治疗早期阶段的已知结果进行比较。

在启动该计划之前,莫菲特团队必须克服一些挑战,包括道德考量和后勤挑战,与临终关怀设施进行沟通,在社区中找到尸检设施并确定尸体标本中的肿瘤。

从2015年11月到2017年11月的两年时间里,莫菲特的研究人员获得了希尔斯伯勒,皮涅拉斯和帕斯科州的21名肺癌患者的同意,可以参与RTD研究。他们从9名死者那里收集了180个肿瘤组织和血液标本,而其余12名患者在本文发表时还活着。

研究人员面临的后勤挑战之一是需要在死后尽快保存标本,以确保组织和分子材料保持完整。所有九名患者的平均标本采集时间为15.8小时。由于不可避免的逻辑复杂性,在死亡的20小时内收集了8个捐献者的样本,在死亡的41小时内收集了1个捐献者的样本。

对标本的分析发现,从同一患者的原发性和转移性肿瘤中提取的大多数DNA样品是相似的,并且包含相同的DNA突变。研究人员还发现了一名患有已知EML4-ALK融合且对ALK抑制剂治疗有抵抗力的患者,出现了AGK-BRAF融合。活化的BRAF可促进肿瘤生长。“这是一个令人信服的发现,因为如果在治疗过程中检测到AGK-BRAF融合蛋白,医生就可以对治疗进行调整,使其包括针对BRAF的药物,”莫菲特肺癌卓越中心医学肿瘤学家兼主任医学博士Eric Haura说道。 。

肿瘤组织样品中蛋白质生物标志物的分析显示,在同一患者的原发性肿瘤和转移性肿瘤中,PD-L1蛋白的表达差异高达55%。PD-L1的水平用作肺癌患者的诊断测定,以确定他们是否应该接受某些药物。

豪拉说:“如果测试不同的肿瘤部位,这项研究中百分之二十到六十的个体会有不同的PD-L1结果。”“这说明了谨慎解释PD-L1结果的重要性,因为大量患者可能不符合基于一个肿瘤部位检测的免疫疗法,但符合基于不同部位肿瘤检测的免疫疗法。”

豪拉(Haura)对RTD计划取得的进展感到高兴,并对即将发生的事情感到高兴。他希望可以将其扩展到其他肿瘤类型,甚至可以与其他机构合作开发。

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