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科学家发现地球物种比以前认为的有更多共同点

导读 地球上存在着丰富的生命形式-从著名的动植物到古细菌,病毒和细菌等小型,更坚固的生命形式。这些生命形式从根本上一直到细胞水平都不同。...

地球上存在着丰富的生命形式-从著名的动植物到古细菌,病毒和细菌等小型,更坚固的生命形式。这些生命形式从根本上一直到细胞水平都不同。左右,科学家认为。

现在,一个国际研究人员团队对从细菌,古细菌到植物和人类的100种不同物种中发现的蛋白质进行了分析。它是有史以来对不同物种进行的最大的蛋白质作图。

他们了解到,这些生命形式实际上具有许多共同特征。这项研究是诺和诺德基金会蛋白质研究中心的马蒂亚斯·曼教授的研究人员与马克斯·普朗克生物化学研究所之间的合作。它已经发表在顶级科学杂志《自然》上。

``我们已经绘制了蛋白质图谱,一起被称为100种不同物种的蛋白质组。很明显,它们有很大的不同。但是,与此同时,它们的共同点比我们想象的要多。在所有这些生命形式中,很大一部分蛋白质都集中在新陈代谢和维持蛋白质平衡上。” Matthias Mann教授说。

实验证实的蛋白质加倍

以前,研究人员主要对各种生物的DNA感兴趣。例如,人类与不同动物共享多少遗传物质。但是,随着用于在分子水平上研究生物的技术的进步,研究人员已将蛋白质视为细胞的主要功能。

所有这些生命形式的一个共同特征是,它们的蛋白质组中有很大一部分专注于保持一种平衡,这称为稳态。另一个共同的特征是大量蛋白质有助于产生能量。即使这样做的方式有所不同-从光合作用到碳水化合物燃烧”,在研究期间受聘于诺和诺德基金会蛋白质研究中心的Alberto Santos Delgado说。

研究人员使用了一种称为质谱的先进技术来研究所有100种。该技术使他们能够将实验确认的蛋白质数量增加一倍。

以前的研究仅根据遗传密码和生物信息学计算预测了存在多少蛋白质。但是,新蛋白质图谱已经提供了有关大量新蛋白质存在的实际数据。

机器学习可以揭示新的关联

``我们将基于质谱的定量蛋白质组学与数据库资源联系起来的工作已产生了800万个数据点和5300万个互连的数据集。我们公开提供了所有数据,使其他研究人员可以使用它来识别新的相关性。马克斯·普朗克生物化学研究所的博士生Johannes Mueller说:``通过机器学习实现的新技术正在兴起,我们希望这些技术将从我们公开提供的庞大而统一的数据集中受益。''

哥本哈根大学的研究人员专注于数据处理和生物信息学分析,而慕尼黑马克斯·普朗克生物化学研究所的研究人员专注于质谱分析。

在生命蛋白质组网站上,研究人员公开了该项目的所有数据。

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