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埃及伊蚊传播病毒表达的蛋白质

导读 根据环境条件,埃及伊蚊的寿命为两到四个星期,在此期间,雌性在接近人类环境的盛满水的容器中产下约一千个卵,因为它需要人类血液才能繁殖...

根据环境条件,埃及伊蚊的寿命为两到四个星期,在此期间,雌性在接近人类环境的盛满水的容器中产下约一千个卵,因为它需要人类血液才能繁殖和完成。它的生命周期。雄性蚊子缺乏血液供应系统,因此只有雌性与人类接触,它们是Mayaro,登革热,基孔肯雅热,黄热病和Zika病毒以及其他病原体的媒介。迄今为止,还没有完全有效的方法来避免这种接触和该物种的感染。

为了确定每种虫媒病毒表达的蛋白质的内在疾病易感性的相似性和差异,并获得识别它们的“指纹”,该研究人员团队开发了一套生物信息学程序来检索极性指数。从UniProt数据库中提取的蛋白质的Method®(PIM®)配置文件和固有疾病易位图。这些程序是在氨基酸序列包含信息的前提下设计的,这些信息定义了给定蛋白质折叠成独特的三维结构或保持固有无序状态并确定其主要功能的能力。

将PIM®配置文件和本征易位图与其他蛋白质组生成的图进行了比较,例如UniProt数据库中的细菌,真菌和病毒,CPP数据库中的细胞穿透肽以及两组固有的无序蛋白质(全部和部分)无序。这项比较分析的特征是虫媒病毒组具有特征性,并通过生成识别它们的特定“指纹”将其与其他蛋白质组区分开。

作者从UniProt数据库的559,228个“经过审查”的蛋白质中发现了1736个蛋白质,这些蛋白质具有与五种虫媒病毒表达的29种突变蛋白质相似的PIM®特性。这些发现表明,PIM®谱图表征可能有助于鉴定埃及伊蚊传播的节肢动物传播的病毒表达的蛋白质。

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