一组研究人员最近证明了利用先前建立的筛选系统来探测小分子和 RNA 之间相互作用的实用性。他们的研究发表在《通讯化学》杂志上。

该团队由 Hirohide Saito 教授(CiRA 生命科学前沿部)、Kaoru R. Komatsu 博士(CiRA 前博士生)、Kazumitsu Onizuka 副教授和 Fumi Nagatsugi 教授(多学科研究所)领导东北大学先进材料)。

从最近用于对抗 COVID-19 大流行的 SARS-CoV-2 mRNA 疫苗，到美国食品和药物管理局批准用于治疗脊髓性肌萎缩症的RNA 剪接修饰剂 risdiplam，“RNA”一词已进入通用语言，因为它代表了两者新型治疗剂和药物靶点。

然而，我们对各种 RNA 序列以及结构如何决定与药物化合物等小分子或蛋白质等大生物分子相互作用的理解仍然不完整。

在之前的一项研究中，Saito 教授和他的研究团队设计了一种名为折叠 RNA 元件分析与结构库(FOREST)的系统，用于检查 RNA 如何与已知 RNA 结合蛋白相互作用的分子细节。

在这项新研究中，通过与东北大学的研究人员合作，联合研究小组展示了如何利用 FOREST 来分析小分子与 RNA 的相互作用。

研究小组首先通过检查 RNA 结构库如何与已知的小分子 RNA 相互作用物(G-clamp 和噻嗪橙 (TO) 衍生物)相互作用来验证 FOREST 方法对小分子的适用性。