在微小的森林defoliator中发现大基因组
欧洲吉普赛蛾(EGM)可能是该国最着名的入侵昆虫 - 19世纪60年代偶然引入北美的一种非本地物种,当时少数人逃离了波士顿郊区的繁殖实验。从那以后,毛毛虫一直在慢慢地穿越大陆,导致广泛的落叶。
在可能导致更好的生物杀虫剂保护森林和果园的研究中,Drs。UT Southwestern的Don Gammon和Nick Grishin对EGM的基因组及其更具破坏性的表亲 - 亚洲吉普赛蛾(AGM)进行了测序。发表在美国国家科学院院刊上的他们的研究发现,吉普赛蛾有最大的蛾或蝴蝶基因组(DNA碱基对的数量)。
“欧洲的吉普赛飞蛾向西延伸到明尼苏达州,南到北卡罗来纳州。相当缓慢的蔓延 - 每年约13英里 - 部分原因是EGM女性不会飞行,必须走路或被吹走在风中驱散,“微生物学助理教授Gammon博士和生物医学研究的小学者WW Caruth博士说。“相比之下,居住在亚洲和俄罗斯东部的亚洲吉普赛蛾亚种的雌性,翅膀更大,更发达,可以飞翔。”
他补充说,如果亚洲吉普赛蛾要在美国建立起来,由于其能够更迅速地传播,它将构成更大的经济威胁。为了防范这种可能性,美国农业部在几个港口开展了监测计划,并定期在濒临灭绝的森林中喷洒基于病毒的生物杀虫剂,以杀死吉普赛蛾毛虫。
除基因组测序外,研究人员还进行了基因表达研究,展示了蛾类基因如何对病毒感染做出反应,以了解如何改善病毒生物杀虫剂以控制吉普赛蛾种群。研究人员说,他们的发现可以作为昆虫脆弱性的路线图。他们还发现了EGM和AGM亚种之间的遗传差异,这些差异可能导致飞行能力,化学传感和病原体相互作用的变化。
Gammon博士在马萨诸塞大学医学院诺贝尔奖获得者Craig Mello博士的实验室博士后工作期间对吉普赛飞蛾产生了兴趣。
在2014年eLife杂志的一项研究中,Gammon博士报告说,吉普赛蛾细胞对虫媒病毒具有惊人的抗性,否则它们会感染各种各样的苍蝇,蚊子和人类细胞。鉴于Zika等虫媒病毒对人类健康的威胁,Gammon博士试图了解吉普赛蛾细胞抵抗的遗传原因,希望能够发现阻止其他物种虫媒病毒感染的新策略。
然而,吉普赛蛾基因组尚未测序,这是鉴定蛾编码的抗病毒因子的明确先决条件。在2016年获得UT西南大学教师职位后不久,Gammon博士询问了生物物理学和生物化学教授Grishin博士以及霍华德休斯医学研究所(HHMI)研究员,他们是否可以合作。当时,Grishin博士的小组刚刚发现了两种新的蝴蝶物种,并对其他几种蝴蝶的基因组进行了测序。
这项合作促成了今天的研究,由京都奖获得者Daniel Janzen博士完成,他是宾夕法尼亚大学生物学教授,因其在进化生态学方面的专业知识而享誉全球。京都奖被认为是日本在获胜者领域全球成就的最高私人荣誉。
Gammon博士说:“美国东北部的每个人都知道欧洲的吉普赛蛾,或者至少熟悉其贪婪饥饿的毛虫对森林造成的破坏。”
研究人员说,接下来的步骤应该包括功能研究,以了解基因是如何工作的。
“从理论的角度来看,我们想了解生物多样性是如何通过蛋白质进化机制产生的,”Grishin博士说道,他持有Cecil H.和Ida M. Green生物医学科学主席,并且是弗吉尼亚州Murchison Linthicum学者在生物医学研究。
该研究的其他UTSW作者包括研究生Jing Zhang和Grishin实验室的前研究生Qian Cong博士和Gammon实验室的研究助理Emily A. Rex。
该研究得到了UT西南大学的捐赠学者计划,国立卫生研究院,韦尔奇基金会和HHMI的支持。
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EGM目前在康涅狄格州,特拉华州,哥伦比亚特区,伊利诺伊州,印第安纳州,缅因州,马里兰州,马萨诸塞州,密歇根州,明尼苏达州,新罕布什尔州,新泽西州,纽约州,北卡罗来纳州,俄亥俄州,宾夕法尼亚州,罗德岛州,佛蒙特州,弗吉尼亚州,西弗吉尼亚州和威斯康星州。