新的证据表明，基孔肯雅病毒至少比公共卫生监测系统检测到的早一年到达巴西。哥伦比亚邮报公共卫生学院和FundaçãoOswaldoCruz感染和免疫中心(CII)的科学家在“科学报告”杂志上发表了他们的研究结果。

使用基因测试QuantiTect / QuantiNova Prove RT-PCR Kit分析2016年3月至2017年6月期间在里约热内卢的Nacional de Infectologia研究所收集的血液样本。该试验确定了基孔肯雅病毒阳性的40个样本，登革病毒和寨卡病毒阴性。研究人员随后使用CII-ArboViroPlex重新测试了这些样本，CII-ArboViroPlex是由CII开发的多重测试，可以同时扫描寨卡病毒，所有血清型的登革病毒，基孔肯雅病毒和西尼罗河病毒。CII测试证实了早期的测试，但更灵敏地执行，表明当其他测试不能时，它可以识别病毒。

使用VirCapSeq-VERT进一步分析了代表15个月收集期的日期的14个样本，该方法是在CII开发的用于病毒诊断，监测和发现的方法。VirCapSeq-VERT能够恢复近乎完整的病毒基因组序列并鉴定病毒，作为基孔肯雅病毒的东 - 中 - 南非基因型的代表。

对14个基因组序列的分析显示遗传差异与采集样本的日期之间存在很强的相关性。这使得研究人员能够根据样本之间的突变速度确定“分子钟”。时间表明该病毒最早可能在2012年流通，很可能是从中非进口的。基孔肯雅病毒于2014年首次由公共卫生监测系统报告。

“随着对寨卡病毒的担忧加剧，越来越多的巴西人接受了感染检测，”该研究的CII研究负责人Nischay Mishra博士说。“与此同时，许多受试者实际上感染了登革热或基孔肯雅病毒，这些症状也存在类似症状。”

“这项研究证明了可以区分这些传染病的敏感诊断技术的价值，并提供了对巴西基孔肯雅热疫情来源的见解，”第一作者Thiago Moreno L. Souza说道，他是里约FundaçãoOswaldoCruz的生物化学教授巴西德里约热内卢。