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高通量变异重新分类有助于 Alagille 综合征诊断

导读 费城儿童医院 (CHOP) 和宾夕法尼亚大学佩雷​​尔曼医学院 (Penn Medicine) 的研究人员开发了旨在改善 Alagille 综合征(一种复杂的...

费城儿童医院 (CHOP) 和宾夕法尼亚大学佩雷​​尔曼医学院 (Penn Medicine) 的研究人员开发了旨在改善 Alagille 综合征(一种复杂的遗传性肝病)诊断的数据。这些发现将有助于减少对错义变异(改变蛋白质的遗传变化)的“意义不明确的变异” (VOUS) 分类,这对其他疾病有影响。这些研究结果今天发表在《美国人类遗传学杂志》上。

阿拉吉尔综合征(又称阿拉吉尔-沃森综合征、综合征性胆管缺乏和动脉肝发育不良)是一种遗传性肝病,也会影响心脏、眼睛、骨骼、肾脏、血管和其他器官,严重程度各不相同。阿拉吉尔综合征主要是由 Jagged1 (JAG1) 基因变异引起的,该基因有助于制造一种蛋白质,控制细胞在正常运作时如何生长并发育成不同类型的组织和器官。

许多蛋白质缩短基因变化很容易被识别为致病因素,并能正确诊断出阿拉吉尔综合征,让患儿接受适当的治疗。然而,高达 85% 的已报道 JAG1 错义变异(突变中一种氨基酸被基因中通常不在该位置的另一种氨基酸取代)的分类不确定或存在矛盾,这意味着阿拉吉尔综合征患者可能会被漏诊。

“我们希望重点关注这些错义变异最有可能出现的外显子,并分析出可以与我们已知的致病变异进行比较的变异,”该研究的第一作者、宾夕法尼亚大学医学院和费城儿童医院病理学和实验室医学研究助理教授 Melissa Gilbert 博士说。“我们使用各种方法开发了一种高通量检测方法,能够在对这些错义变异进行分类时减少不确定性,并提高我们对阿拉吉尔综合征进行更准确诊断的能力。”

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