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研究为海滩季节及时提供基因组警告标志

导读 今天发表在开放获取期刊GigaScience上的一篇文章可能会让你在今年夏天打算去海滩时感到不安。本文介绍了三种不同水母物种的基因组草图。由J...

今天发表在开放获取期刊GigaScience上的一篇文章可能会让你在今年夏天打算去海滩时感到不安。本文介绍了三种不同水母物种的基因组草图。

由Joseph Ryan领导的国际研究小组选择检查具有一系列物理特性和毒性水平的水母(从轻微的烦恼到致命) - 水母每年杀死的人数多于鲨鱼,黄貂鱼的综合力量,和海蛇。他们的研究确定了一系列毒液相关基因,为探索这些迷人动物的毒素基因进化奠定了基础。

被调查的三种水母物种是致命的有翼水母(Alatina alata),解剖学上有趣的颠倒水母(一种真正的水母:Cassiopea xamachana),以及因其刺痛的器官而形成马耳他十字架而闻名的水母(Calvadosia cruxmelitensis)。图案。这里的工作最终提供了所有五个谱系的中胚层(刺胞动物的亚门)的基因组序列。

通过这些新的基因组,我们第一次能够比较所有5类刺胞动物(Anthozoa,Hydrozoa,Cubozoa,Staurozoa,Scyphozoa)的基因含量。这项广泛的调查提供了对cnidarians基因组进化的重要概述。“

与毒性脊椎动物毒理学研究的进展相比,由于缺乏广泛的遗传信息,刺胞动物的毒理学研究受到了阻碍。由于箱形水母对海滩观众来说是致命的,所以刺胞动物毒液的区域特别令人感兴趣:每年大约有100人死于叮咬。它们被认为是非常危险的,它们是美国天气报告中唯一拥有自己类别的水母。

为了研究毒素,作者确定了117种推定的毒液蛋白,其中9种仅在刺胞动物中发现。翼翅水母基因组是唯一一个包含称为CqTx的毒素基因的基因组。CqTx蛋白在细胞膜中产生孔隙,导致溶血,红细胞分解。鉴于一些盒状水母可以在5分钟内阻止某人的心脏,在翼状水母箱中识别这种毒素,增加了另一个线索,即仍然不清楚人们如何死于箱形水母刺痛的机制。

基因组的比较还揭示了关于刺胞动物毒液进化的信息。基因丢失和基因重复在物种进化中都发挥着重要作用,例如,科学家对另一种毒素基因CrTx的分析显示了两者。颠倒的水母含有单一的CrTx基因,有翼的水母箱有5个这个基因的拷贝;并且偷偷靠近的水母没有。

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