许多人将“细菌”这个词与肮脏和恶心的东西联系在一起。Pere Santamaria博士不同意。Santamaria说，被称为微生物组，我们体内的细菌对我们的健康产生各种积极影响。“我们肠道中的细菌实际上有许多有益的功能。它们有助于我们的消化，预防病原体的感染，并教育我们的免疫系统对抗什么。“现在，肠道微生物组中蛋白质的新功能揭示了对患有炎症性肠病(IBD)的人的潜在影响。

卡尔加里大学康明医学院(CSM)的Santamaria和Kathy McCoy博士在Cell上发表了一项研究，揭示了肠道微生物组中一种调节促炎细胞和抗炎细胞的新机制。“我们发现，一种名为Bacteroides的肠道细菌表达的蛋白质通过快速募集白细胞来杀死负责编排IBD的免疫系统细胞来预防IBD，”McCoy说。“我们认为这种机制可能会阻止大多数人患上IBD。”

然而，蛋白质寻求帮助的另一面还有另一面。“在某些人中，白细胞对IBD细菌的存在反应过度。这就是导致IBD等问题的原因 - 它不是细菌本身，而是免疫系统由蛋白质引发的严重反应。这些过度刺激的白细胞也是导致其他自身免疫性疾病如糖尿病的细胞，“Santamaria说。“这一发现证明了肠道微生物组对免疫系统的影响，并揭示了一种新的机制，通过这种机制，肠道微生物组的变化可以增加自身免疫性疾病的风险。虽然我们特别关注IBD，但很可能肠道中有许多蛋白质通过类似机制促成其他自身免疫性疾病的发展。“

对肠道微生物组的研究需要在动物模型中分离单个细菌以排除其他环境因素。“这是无菌小鼠首次开始我们的研究合作，”McCoy说。在加入UCalgary之前，McCoy正在瑞士伯尔尼大学与无菌小鼠合作。“博士Santamaria给我发送了他的小鼠品系，使它们无菌，然后我们能够添加回单个微生物种类，这些微生物种类在肠道中表达或不表达蛋白质，以研究它们的效果。“六年后，这对仍然在一起工作并展望未来发现的影响。

虽然需要进行更多的研究，但Santamaria和McCoy乐观地认为，将开发利用肠道微生物组的力量的新疗法。新的加拿大西部微生物中心(WCMC)的无菌设施于2017年11月在CSM开放，将为研究肠道细菌提供完美的空间。“我们将能够研究特定的肠道微生物组，而无需考虑其他环境变量，”WCMC主任McCoy说。“这将有助于我们进一步开展此项研究，并完成许多其他关于微生物群效应的研究。”