费城，2019年8月12日 - 百分之九十九宫颈癌是由人乳头瘤病毒(HPV)引起的。超过200种HPV，其中一些与不同程度的癌症风险相关，使诊断和治疗变得复杂。一个报告在杂志分子诊断的，由Elsevier出版，描述了一个新的“二换一”的诊断方法，不仅检测HPV感染的类型，但也预示癌前标记。该测试可以提高诊断风险最高形式的HPV感染的能力，以低成本提供快速结果，并帮助避免不必要的诊断程序。

“我们开发了HPV RNA-Seq，一种新型的体外分子诊断程序，用于检测高危HPV感染，并鉴定高级别鳞状上皮内病变(HSIL)患者，这是宫颈癌的一个癌前期。 HPV RNA-Seq是一项独特的测试，结合了分子检测(HPV分型)和宫颈细胞学(细胞表型分析)的优势，“首席研究员Marc Eloit解释，病原体发现实验室，生物学研究所，生物学研究所，Institut巴斯德巴斯和法国Maisons-Alfort巴黎东部大学Alfort国立兽医学院。

宫颈癌筛查允许在癌症发展之前检测和治疗癌前病变。目前，筛查要么侧重于检测HPV，要么通过细胞学鉴定异常宫颈细胞。然而，检测病毒的DNA或RNA的分子诊断测试在鉴定癌症或癌前病变方面很差。使用巴氏试验对宫颈细胞进行分析，即使与高风险HPV的分子检测相结合，也会导致大量不必要的阴道镜检查，这是一种侵入性检查，医生通过该检查可视地检查宫颈病变。

在这项概念验证研究中，HPV RNA-Seq用于分析来自55名患者的样本，28名患有低度鳞状上皮内病变(LSIL)和27名患有癌前HSIL的患者。

HPV RNA-Seq能够在一组16种高风险HPV中检测和确定HPV感染的类型，其结果与广泛使用和官方批准的HPV DNA分子诊断试剂盒相当。事实上，HPV RNA-Seq检测到的两名HPV阳性患者比DNA检测更多，并且还发现了更多患有多种HPV感染的患者。

发现该试验具有97.3%的敏感性(检测HPV存在的能力)和阴性预测值(NPV，没有HPV的可能性)为93.8%。“有效的宫颈癌筛查需要高敏感性和NPV用于高风险HPV感染，因为HPV检测阴性的女性通常仅在几年后再次进行检测，”Eloit教授指出。

细胞学被用作对HPV患者进行分类的快速方法，而组织学被认为是宫颈癌诊断的金标准。然而，组织学分析更具侵入性，需要更多时间才能产生结果。为了确定新的测试是否在宫颈癌分类中占有一席之地，研究人员还将细胞学与HPV RNA-Seq进行了比较，并发现了高级细胞学的标记，HPV-RNA-Seq的诊断性能令人鼓舞，作为分类测试。他们还发现HPV RNA-Seq与组织学的阳性预测值(PPV，HPV感染的可能性)总是大于细胞学与组织学的PPV。“与细胞学相比，这一观察结果有利于HPV RNA-Seq可能增加的医学价值，”Eloit教授评论道。

Eloit教授建议在某些患者中使用HPV RNA-Seq可以帮助消除不必要的阴道镜检查。他还预见到技术将允许同时运行多个样品的时间，每次测试的成本降低到10美元到20美元。该测试也可适用于其他HPV相关癌症，例如肛门癌和头颈癌。

HPV RNA-Seq基于多重逆转录PCR(RT-PCR)和下一代测序(NGS)的双重组合。RT-PCR是一种测量少量RNA的敏感方法，即反映HPV基因活性的遗传物质，NGS可以精确表征扩增的病毒序列的多样性。这样可以检测样品中多达16种高风险或假定的高风险HPV以及癌前标记物的存在。

“我们的方法遵循目前开发用于分子诊断的NGS扩增子板的趋势，同时保持适应传统的分子检测格式。这种灵活性可以使HPV RNA-Seq成为许多实验室方便，强大且经济实惠的解决方案，”主要作者Philippe补充说。 Pérot，博士，病原体发现实验室，感染单位生物学，巴斯德研究所，法国巴黎。