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酶与染色体相互作用时起作用的新图像可以提供重要的洞察力

导读 酶与染色体相互作用时起作用的新图像可以提供重要的洞察力,以了解细胞(包括癌细胞)如何调节其基因。LSD1酶可以通过去除核小体中化学标记(...

酶与染色体相互作用时起作用的新图像可以提供重要的洞察力,以了解细胞(包括癌细胞)如何调节其基因。LSD1酶可以通过去除核小体中化学标记(甲基)来“关闭”基因表达,核小体是染色体中紧紧堆积的DNA和蛋白质单元。该LSD1组蛋白脱甲基酶在多种癌症类型中过表达,导致正常细胞发育受到破坏,新结构可为靶向该酶的治疗性干预提供依据。

宾夕法尼亚州立大学研究人员的一篇论文描述了LSD1-核小体复合物的晶体结构,发表在6月4日的《分子细胞》杂志上,还解释了分离的辅助蛋白CoREST以前不清楚但很重要的作用。

尽管先前的研究仅用一小部分核小体(组蛋白尾巴)对LSD1和CoREST进行了成像,但我们设法用整个核小体核心颗粒对这些蛋白质进行了成像,以更好地了解它们在基因调控中的作用。”

Tan还是宾州州立大学真核基因调控中心的主任

“我们知道LSD1需要辅助蛋白CoREST才能在核小体上工作,但是我们不知道CoREST在做什么。当我们看到这种结构时,我们最初感到惊讶,但后来意识到一切都有意义。”

研究小组发现,LSD1意外地结合到核小体核心的外部,而核小体上的大部分活性都发生在核小体上。相反,LSD1与远离核心的DNA结合,而CoREST充当中介,既与核小体核心又与LSD1结合。

谭说:“这令人惊讶,因为所有其他已成像的酶都直接结合到它们工作的核小体核心上。”

该结构还解释了CoREST辅助蛋白如何使LSD1在核小体上起作用。研究人员认为,LSD1-CoREST系统可以作为其他辅助蛋白如何将染色质酶靶向核小体的模型。

谭说:“ LSD1就像飞行员一样,需要导航员才能知道去哪里。” “ CoREST辅助蛋白充当将LSD1靶向核小体的导航器。”

该研究小组还研究了一种LSD1酶的变体,该变体被认为具有使其失活的突变。这种无活性的突变体已用于测试消除细胞中LSD1活性的作用。但是,研究小组发现该突变体在核小体存在的情况下实际上具有活性。

Tan说:“基于仅使用核小体的组蛋白尾部的分析,LSD1 K661A突变体被认为是无活性的。”

“但是,当我们使用整个核小体核心颗粒(更能代表细胞中实际存在的核糖核酸)时,我们发现该突变体非常活跃。这意味着将LSD1 K661A用作非活性突变体的研究结论需要由于该酶的活性实际上并未消除,因此需要重新评估。

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