圣裘德为小儿脑肿瘤研究创造新的资源
圣裘德儿童研究医院的科学家创建了代表各种儿科脑肿瘤类型的原位患者源异种移植(O-PDX)模型。这些模型具有分子特征,可通过基于云的数据门户网站获得。神经病理学学报最近发表了一份详细介绍这些模型的报告。
脑肿瘤是影响儿童的最常见实体瘤。O-PDX是在患者和父母的同意下通过在免疫受损的小鼠中原位植入癌细胞或在同一组织内植入癌细胞而创建的研究模型。这些模型最近成为测试新疗法的一种有用方法,因为它们仍然忠实于它们衍生出的原始肿瘤的生物学特性。
“我们首先研究了髓母细胞瘤,并需要一个可以用来筛选新疗法的良好模型,”圣裘德肿瘤细胞生物学的相应和共同资深作者马丁·罗素博士说。“我们当前的模型数据库是我们实验室以及许多外科,肿瘤学,病理学和计算生物学合作者多年工作的结果。”
圣裘德的研究人员创建了37个O-PDX模型,这些模型是由患者家属捐赠的小儿髓母细胞瘤,室管膜瘤,非典型类畸胎瘤样横纹肌瘤和胚胎肿瘤的样本生成的。科学家结合组织病理学,全基因组和全外显子组测序,RNA测序和DNA甲基化分析,对这些模型进行了全面表征。O-PDX基于个体基因组提供了一种新颖的建模策略。
圣裘德小儿神经外科科主任弗雷德里克·布普(Frederick Boop)医学博士说:“要有效治疗儿童脑瘤,我们需要在工具包中增加其他治疗策略。“需要许多不同的科学和医学专业共同努力,才能创建这类模型并进行必要的临床前研究,从而为新的临床试验铺平道路。”
在圣裘德,其中一些模型所做的工作为开展三项针对小儿脑肿瘤的临床试验(SJMB12,SJDAWN和SJELIOT)提供了支持。
O-PDX模型及其相关数据可通过作为St. Jude Cloud一部分的基于Web的交互式门户获得。St. Jude Cloud通过基于云的基础架构为儿童癌症和其他儿童灾难性疾病提供数据和分析资源。