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抗体结构已发布到蛋白质数据库中

导读 致力于降低生命科学创新障碍的全球性非营利联盟-皮斯托亚联盟今天宣布,其增加抗体(Ab)结构知识的项目已达到其第一个主要里程碑–已存...

致力于降低生命科学创新障碍的全球性非营利联盟-皮斯托亚联盟今天宣布,其增加抗体(Ab)结构知识的项目已达到其第一个主要里程碑–已存放12种抗体结构进入欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)蛋白质数据库(PDB)。该项目的目标是生成新颖的Ab结构,并改善整个生命科学中Ab结构的数据共享。这将提高研究人员的预测能力以及他们对Ab结构进行精确建模的能力;大大减少了与生成实验数据以支持药物项目决策相关的时间和成本。

“人类有能力产生100亿个不同的Ab分子,目前,在公共领域只有大约3,000个Ab结构。因此,在我们对典型的人类Ab曲目的结构理解上仍然存在很大的差距。”项目经理Richard Norman博士评论道。“这些数据是药物发现的基础,我们需要弥合我们的知识差距,这就是为什么皮斯托亚联盟超越项目特别重要。”

在发现生物药物期间,准确的Ab结构信息的可用性是设计高质量候选药物的关键。目前,当缺少这些信息时,研究人员有两种主要选择来生成数据。首先是通过实验确定Ab的3D结构,这通常是通过X射线晶体学完成的-此选项占用大量资源,昂贵且无法保证正常工作。第二个是使用来自PDB的现有Ab结构作为模板来生成模型-此选项快速且具有成本效益,但依赖于与未知结构高度相似的模板结构以确保准确的结果。由于目前我们对Ab结构的理解存在差距,

“我们在这个领域所做的努力,就像我们承担的所有项目一样,旨在使整个生命科学领域(从学术界到研究到商业环境)的生活更加轻松。我们现在需要制药和生物技术组织的广泛参与,”皮斯托亚联盟主席史蒂夫·阿灵顿博士说。“这不仅将通过汇集知识来扩大研究预算,而且还将在整个行业内促进Ab建模,并最终对药物发现产生影响。我们需要在公共领域建立更多的结构,而这只有通过更愿意在组织之间和组织内部共享数据才能实现。”

将数据释放到PDB中,标志着AbVance项目迈出了重要的第一步。Pistoia Alliance AbVance项目团队对这些数据的初步分析表明,即使今天发布的结构与PDB中已经可用的结构相似,也存在一些细微的差异,这可能是至关重要的。皮斯托亚联盟AbVance项目小组已经确定了另一套Ab结构。现在,它鼓励其他组织参与该项目,并支持计划于2018年第一季度发布的下一版本数据。项目团队还致力于生成新颖的结构信息,以在2018年底前发布。

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