小型研究表明样品失活可能导致SARS CoV2假阴性
2024-02-15 02:15:02
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导读 华盛顿特区-2020年6月2日-为了在测试SARS-CoV-2临床样品时保护医学实验室人员免受感染,大多数实验室在测试之前将病毒灭活。,尚未确定灭活...
华盛顿特区-2020年6月2日-为了在测试SARS-CoV-2临床样品时保护医学实验室人员免受感染,大多数实验室在测试之前将病毒灭活。,尚未确定灭活对检测结果的影响,但一次灭活测试的假阴性率估计为30%至50%。
西安市疾病预防控制中心马超峰领导的一组研究人员推测,病毒灭活可能会导致假阴性。他们现在已经测试了几种灭活方法,以确定它们是否减少了临床样品中可检测到的病毒以及在何种程度上减少了可检测的病毒。该研究发表在《美国临床微生物学杂志》上。
研究人员从63名已感染SARS-CoV-2的患者中提取了临床样本。他们首先使用了一种称为数字PCR的技术来确定每个样品中病毒颗粒的总数。
然后,他们从样本中灭活了病毒,并确定了在基因组的2个位点可检测到的病毒少得多,该基因编码“核衣壳”蛋白,基因组的一部分称为ORF 1ab。
第一次灭活处理使用称为TRIzol的试剂,破坏了47.54%的核衣壳基因和近40%的ORF 1ab。
第二次灭活处理将样品加热到56°C 30分钟,并使基因组两部分的数量分别减少了48.55%和56.40%。加热至80°C 20分钟,进一步减少了病毒拷贝数,煮沸或在121°C高压灭菌后几乎没有发现可检测的病毒。
研究人员写道,除TRIzol外,未来的研究应包括灭活试剂。但是目前,“ ...建议将TRIzol用于样品灭活...因为在测试的方法中,TRIzol对RNA拷贝数的影响最小。”
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