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大量的遗传差异研究揭示了多种疾病的新靶标

导读 2020年1月14日-尽管在许多健康人​​中发现了从一个人复制并传给另一个人的基因数量上的细微差异,但它们在疾病中的作用可能比以前想象的要...

2020年1月14日-尽管在许多健康人​​中发现了从一个人复制并传给另一个人的基因数量上的细微差异,但它们在疾病中的作用可能比以前想象的要大得多。

一项由费城儿童医院(CHOP)的研究人员领导的大型,多中心研究比较了超过10万欧洲血统的基因组数据,发现相对罕见的遗传变异如何影响多种常见疾病。

此外,由于已知这些疾病的遗传基础,因此可以将现有药物重新用于应对这些疾病-从自身免疫性疾病到神经心理学疾病甚至癌症。研究结果于2019年1月14日在线发表在《自然通讯》杂志上。

拷贝数变异(CNV)是获得或丢失基因组信息,并且当特定基因或基因组区域的拷贝数从一个个体到另一个个体变化时发生。罕见的CNV是经常使人们容易患病的事件,而更常见的CNV通常具有良好的耐受性,并且在健康人群中很常见。但是,以前已经建立了一些示例,其中CNV会对人体健康产生负面影响。实际上,先前的研究表明它们可能对人类健康产生广泛的影响,但是其中大多数研究都是基于有限的样本量,因此无法为研究人员提供对其真正意义的完整描述。

高级作者Hakon Hakonarson表示:“这项分析为我们提供了罕见的经常性拷贝数变异影响的密集图,这代表了我们基因组中遗传变异的重要来源,常常使我们容易患上并有时导致复杂疾病。”医学博士,CHOP应用基因组学中心主任。“我们的研究表明,以前的方法可能无法捕获直接影响人类健康的罕见拷贝数变异区域的准确发生率或流行率。”

研究小组使用全基因组SNP阵列或阵列比较基因组杂交平台对欧洲血统的100,028个人进行了基因分型。绝大多数(超过99%)未发现的CNV区域是复发性的,这意味着它们至少发生在两个个体中。

在这些与临床最相关的区域中,是那些具有纯合缺失或同一基因对的两个等位基因或基因的两个拷贝都缺失的区域。研究小组确定了375个以前未报告的区域,例如。除了从先前的研究中确认与疾病相关的CNV区域外,研究人员还发现了几个先前未报告的区域,这些区域与已经具有临床意义的基因相匹配,在某些情况下,因为靶向相关途径的药物可能已经存在。

在这项研究中确定的一些特定的感兴趣区域包括与自身免疫性疾病相关的chr7p15.3缺失,因为它与编码ITGB8a(一个公认的卵巢癌靶向药物)的基因重叠;一个纯合的缺失区,与chr2q34处的自身免疫性相关,该区会中断基因ERBB4的编码区,该基因是多种FDA批准的小分子抑制剂可靶向的关键癌基因;编码基因HCN2的基因座chr19p13.3可能成为治疗癫痫和疼痛的潜在靶标。

哈科纳森说:“在我们的研究中发现的有待进一步研究的基因候选者的数量,建立了拷贝数变异区域与我们已经知道的基因组之间的强相关性。”“尽管针对新发现者的正在进行的大规模研究很重要,但我们认为,同时并行研究这些新发现的区域将继续产生更多的临床相关信息,并加速精准医学的发展。”

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